物流在日本大約始于20世紀六七十年代，其主要的運作流程與運作模式始于豐田汽車制造公司為進一步提高管理效益，降低生產(chǎn)成本開始的。豐田公司開始從倉庫管理著手進行改革，把倉庫從各自所屬的生產(chǎn)廠家中脫離出來，成立專門的倉儲中心，集中存放并管理各生產(chǎn)廠家的零部件，直接供應總安裝車間。這一管理方法，當時為豐田公司所專有。不久后，這一管理模式迅速在日本全國得到推廣。倉庫管理的變革，大大地促進了運輸業(yè)的發(fā)展，從而在日本就有了專門從事倉儲管理和貨物運輸?shù)奈锪髌髽I(yè)。
物流企業(yè)的生產(chǎn)流程，主要有兩個方面：一是圍繞顧客訂貨而進行的管理內(nèi)容，二是圍繞生產(chǎn)廠家的管理內(nèi)容。因此，物流企業(yè)是連接生產(chǎn)廠家和顧客的中介，生產(chǎn)廠家既可以直接從顧客中獲取需求信息，更可以從物流企業(yè)中獲取更為綜合的信息。物流企業(yè)的收入主要是租用倉庫而收取的保管費、裝卸費和提供運輸?shù)馁M用。
在日本，保管費一般為3期／月制，即分1日——10日、11日——20日、21日——月末三期計費。從一期當中的任何一日入庫為開始期，一期當中的任何一日出庫為結(jié)束期。如從5日入庫到29日出庫應計三期費用。 這樣的計算方式對物流企業(yè)來說是非常有利的。目前，一些生產(chǎn)企業(yè)也提出要求修改計費方式，按實際天數(shù)計費。
日本物流業(yè)的管理實行許可制。要求經(jīng)營的企業(yè)提出申請，由日本的運輸省負責審批，運輸省駐當?shù)氐呐沙鰴C構(gòu)負責管理。
在日本，一般的物流企業(yè)在東京、名古屋、大阪、神戶等大城市或周邊地區(qū)建有分中心，以達到快速轉(zhuǎn)運、分運的目的。
電子商務離不開物流配送，而物流必須依托電子商務。在日本，已經(jīng)有全國通用的商務網(wǎng)絡。在物流企業(yè)里，除了有和顧客、生產(chǎn)商相連接的電子網(wǎng)絡，還有和海關(guān)報關(guān)、稅務、檢驗等部門相連接的電子網(wǎng)絡。只有這樣，才能實現(xiàn)消費者、生產(chǎn)者之間需求信息快速有效的流動。
